تعداد 120 نمونه ماهی بالغ کیلکای معمولی خزری (Clupeonella cultriventris)، در فصول بهار و تابستان از حوضه جنوبی دریای خزر (بندر انزلی و بابلسر) جمعآوری گردید. از 15 جفت پرایمر میکروستلایت طراحی شده برای شگ ماهیان روی DNA ژنومی ماهی کیلکا استفاده گردید. سپس فراوانی آللی، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و قابل انتظار، شاخصهایFST،RST و FISمحاسبه شد. پنج جفت از پرایمرها جایگاههای چند شکلی تولید کردند که از آنها برای آنالیز تنوع ژنتیکی ماهیان بالغ کیلکای معمولی استفاده گردید. میانگین آللی در جایگاهها 1/13 (دامنه آللی 5 تا 22 آلل در جایگاهها، 5/9=Ne) بود. تمامی مناطق و فصول نمونهبرداری دارای آللهای اختصاصی بودند. میانگین هترزیگوسیتی مشاهده شده و قابل انتظار بترتیب 348/0 و 877/0 بدست آمد. انحراف از تعادل هاردی وینبرگ در بیشتر موارد دیده شد. براساس تست AMOVA در بررسی شاخصهای FST،RST و جریان ژنی و همچنین فاصله ژنتیکی بین جمعیتها، نشان از وجود جمعیتهای مجزا میباشد. مطالعه حاضر، اطلاعات اولیه ای در خصوص تنوع و تمایز ژنتیکی در جمعیتهای ماهی کیلکای معمولی در فصول و دو منطقه مختلف دریای خزر نشان میدهد.