<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Scientific Fisheries Journal</title>
<title_fa>مجله علمي شيلات ايران</title_fa>
<short_title>isfj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://isfj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1026-1354</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2322-5998</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.isfj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>26</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی مورفوتایپ های رنگی گونه (Leptodius exaratus  (Brachyuran: Xanthidae بر اساس مطالعات مولکولی و میکروسکوپ الکترونی
</title_fa>
	<title>Identifying color morphotypes of the species Leptodius exaratus (Brachyuran: Xanthidae) based on the molecular and electron microscopy studies</title>
	<subject_fa>بيوسيستماتيك آبزيان</subject_fa>
	<subject>بيوسيستماتيك آبزيان</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بر اساس مطالعات مورفولوژی، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Leptodius exaratus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; تنها گونه شناخته شده از جنس &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Leptodius&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; است که تاکنون در سواحل صخره&amp;shy;ای خلیج فارس یافت شده&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;است. از آنجایی &amp;shy;که وجود گونه&amp;shy; های مخفی در میان سخت&amp;shy;پوستان دریایی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;بسیار رایج است، هدف مطالعه حاضر، بررسی احتمال شناسایی گونه&amp;shy; های مخفی در میان 8 مورفوتایپ رنگی است که در مطالعات مورفولوژیک به عنوان گونه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Leptodius exaratus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; شناسایی شده بودند. بدین منظور، از 8 الگوی رنگی منسوب به گونه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Leptodius exaratus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; از سواحل صخره&amp;shy;ای استان بوشهر نمونه &amp;shy;برداری انجام شد. سپس اولین گونوپودهای جنس نر، جداسازی شده و با میکروسکوپ الکترونی اسکنینگ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;SEM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;عکسبرداری شدند. جهت مطالعات مولکولی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; نمونه&amp;shy;ها با استفاده از روش فنل-کلروفروم استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;COI&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;تکثیر و توالی&amp;shy; یابی شد. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که توالی نوکلئوتیدی این قطعه ژنی میتوکندریایی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;COI&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در تمام مورفوتایپ&amp;shy;های رنگی بر هم منطبق نمی&amp;shy;باشند و این نتایج در توپولوژی درختان تکاملی برای هر دو آنالیز &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Maximum likelihood, Bayesian&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;منعکس شد. مطالعه فراساختار قسمت راسی اولین گونوپود جنس نر نیز نشان داد، تفاوت&amp;shy;هایی اساسی در قسمت راسی این اندام در برخی مورفوتایپ&amp;shy;های رنگی دیده می&amp;shy;شود. این نتایج نشان می&amp;shy;دهد که تمامی نمونه&amp;shy; ها احتمالاً متعلق به یک گونه نمی&amp;shy;باشند و در میان آنها گونه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;های پنهان وجود دارند. شواهد مولکولی همچنین نشان داد، توالی 8 مورفوتایپ رنگی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Leptodius&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt; &lt;em&gt;exaratus&lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; از خلیج فارس و توالی ثبت شده این گونه از اندونزی در کلادهایی جداگانه قرار گرفته&amp;shy;اند. شناسایی بر اساس مورفولوژی اولین گونوپود جنس نر توسط میکروسکوپ الکترونی اسکنینگ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;SEM&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;و ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;COI &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;روش&amp;shy;های تحقیق کارآمدی در مطالعه حاضر بودند. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div&gt;
&lt;hr align=&quot;left&quot; size=&quot;1&quot; width=&quot;33%&quot; &gt;
&lt;div&gt;
&lt;div id=&quot;_com_1&quot; uage=&quot;JavaScript&quot;&gt;&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;According to morphological studies, &lt;em&gt;Leptodius exaratus&lt;/em&gt; is one of the most common brachyuran species and the only known species of this genus which have been found in intertidal rocky shores along the Persian Gulf coast. Since the existence of hidden species among the crustacean species are very common, the aim of this study is to investigate the probability of hidden species identification among eight color morphotypes that were identified as &lt;em&gt;Leptodius exaratus&lt;/em&gt; species in morphological studies. For this purpose, eight color morphotypes of &lt;em&gt;Leptodius exaratus&lt;/em&gt; species were collected from rocky shores of Bushehr province. Then, the first male gonopods were separated and photographed by Scanning Electron Microscopy (SEM). For conducting molecular studies, DNA was extracted with a phenol-chloroform mixture and mitochondrial Cytochrome Oxidase subunit I (COI) gene was amplified and sequenced. The results showed that mitochondrial COI nucleotide sequences were not identical in all color morphotypes. These results were reflected in topology of evolutionary trees for both analyses (maximum likelihood, bayesian). Studying the ultrastructure of the apical segments of the first male gonopods showed fundamental differences in the apical organs of some color morphotypes. These results indicated that all samples did not belong to a single species and there were hidden species among them. Molecular evidence also showed that mitochondrial COI nucleotide sequences of eight color morphotypes of &lt;em&gt;Leptodius&lt;/em&gt; &lt;em&gt;exaratus&lt;/em&gt; from the Persian Gulf and the registered sequence of such species from Indonesia were in separate clusters. Identification based on the morphology of the first male gonopods using scanning electron microscopy (SEM) and the COI gene were useful research methods in the present study.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>Leptodius exaratus, مولکولی, COI, گونوپود, خلیج فارس</keyword_fa>
	<keyword>Leptodius exaratus, Molecular, COI, Gonopod, Persian Gulf</keyword>
	<start_page>139</start_page>
	<end_page>148</end_page>
	<web_url>http://isfj.ir/browse.php?a_code=A-10-1646-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>F.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chenari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فریده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چناری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>chenari_bio@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016701</code>
	<orcid>100319475328460016701</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>M. B.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nabavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد باقر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نبوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nabavishiba31@gmail.com</email>
	<code>100319475328460016702</code>
	<orcid>100319475328460016702</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>M.A.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Salari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سالاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>salari@kmsu.ac.ir</email>
	<code>100319475328460016703</code>
	<orcid>100319475328460016703</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Savari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سواری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>savari53@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016704</code>
	<orcid>100319475328460016704</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>H.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zolgharnein</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ذوالقرنین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zolgharnein@kmsu.ac.ir</email>
	<code>100319475328460016705</code>
	<orcid>100319475328460016705</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
