<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Scientific Fisheries Journal</title>
<title_fa>مجله علمي شيلات ايران</title_fa>
<short_title>isfj</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://isfj.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1026-1354</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2322-5998</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.isfj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>28</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تجزیه و تحلیل ساختار کامل ناحیه دی لوپ میتوکندریایی به همراه 
موتیف‌های تنظیمی در 4  گونه ماهیان خاویاری دریای خزر
</title_fa>
	<title>Analysis of complete structure of mitochondrial D-loop region with   
regulating motifs in four sturgeon species of the Caspian Sea
</title>
	<subject_fa>ژنتيك و اصلاح نژاد</subject_fa>
	<subject>ژنتيك و اصلاح نژاد</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;این&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;پژوهش قطعه کامل دی لوپ به همراه موتیف&#8204;های تنظیمی آن در&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;چهار&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;گونه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;از ماهیان خاویاری دریای خزراز&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;جنس &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;Acipenser&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; (چالباش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;A.Gueldenstadtii&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، قره برون &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;A.persicus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، شیپ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;A.nudiventris&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، اوزون برون &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;A.stellatus&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;) مورد بررسی قرار گرفت. استخراج &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;با&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;استفاده از روش استات آمونیوم و واکنش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; توسط یک جفت آغازگر اختصاصی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;جهت &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;تکثیر ناحیه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;کامل دی لوپ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;انجام گرفت. توالی&#8204;یابی با استفاده&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;از روش سنگر&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;انجام شد. توالی تکراری مینی ستلایت در ناحیه بالادست دی لوپ و بعد از توالی کدکننده &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;تی آر ان آ پرولین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در همه گونه&#8204;ها به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;جز شیپ مشاهده شد. نتایج نشان داد که واحدهای تکراری مرکزی 83-82&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;جفت بازی با&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;2/3 تکرار در چالباش و قره&#8204;برون و 4/2 تکرار در اوزون&#8204;برون سبب تنوع طول در این ناحیه شده است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;علاوه بر&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;این&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; توالی تکراری مرکزی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; دو توالی تکراری دیگر با اندازه 39 و 43 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;جفت&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;باز نیز در این بخش مشاهده شد &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;که&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;این توالی ها نیز با 2/3&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;تکرار در این ناحیه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;وجود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;داشتند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;طول ناحیه کنترلی در گونه&#8204;های چالباش، قره&#8204;برون، اوزون&#8204;برون و شیپ به ترتیب برابر با 921، 870، 826 و 839 جفت باز بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بررسی ساختار کلی ناحیه دی لوپ نشان داد که ناحیه کنترلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp; &lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ماهیان خاویاری شامل همولوگ&#8204;هایی از بلوک&#8204;های توالی محافظت شده &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;CSB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b compset;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; می&#8204;باشد که واحد های تکراری مینی ستلایت در بالادست این بلوک&#8204;ها واقع شده&#8204;اند. حضور توالی&#8204;های تکراری مینی ستلایت در ناحیه کنترلی دی لوپ اهمیت این نشانگرها را در برنامه&#8204;های حفظ منابع ژنتیکی و غربالگری ماهیان خاویاری نشان می&#8204;دهد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;In this study, analysis of complete structure of mitochondrial D-loop region with its regulatory motifs was investigated in four species of the Acipenser of Caspian sea (&lt;em&gt;A. gueldenstadtii, A. persicus, A. stellatus, A. nudiventris&lt;/em&gt;). DNA extraction was done by acetate Ammonium method and PCR reaction were performed by a pair of specific primers for the complete amplification of D-loop along with sequences associated with tRNA-threonine and proline. Sequencing on amplified fragments were was done on both strands. Repetitive sequence of tandem repeat (mini-satellite) was observed in the upstream site of D-loop region after the sequence of tRNA proline in all species except the Ship. The results showed that the central repetitive units of 83-82 pairs with 3.2&amp;nbsp; repetitions in &lt;em&gt;A. persicus&lt;/em&gt;&amp;nbsp; and &lt;em&gt;A. gueldenstaedtii&lt;/em&gt; and 2.4&amp;nbsp; repetitions in &lt;em&gt;A. stellatus&lt;/em&gt; were the reason for the length variation in this region. In addition to the central repeat sequences, there were two more repetitive sequences of 39 and 43 bp in this section, which were also present with 3.2&amp;nbsp; repetitions. But none of these repetitive sequences was observed in ship. The length of the control region in the A. gueldenstadtii, A. persicus, A. stellatus, A. nudiventris was 921, 870, 826 and 839 bp, respectively. The overall structure of the D-loop region showed that the sturgeon control region is similar to that of other fish, including the homologues of the CSB -conserved&amp;nbsp; blocks, which are located on the upstream of these blocks. According to the presence of tandem repeat (mini-satellite) in control D-loop region and also the importance of these markers in conservation programs for genetic resources it&amp;nbsp; may be possible to use them in screening of sturgeon species.&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa> توالی‌یابی, دی لوپ میتوکندری, ماهیان خاویاری, مینی ستلایت, دریای خزر</keyword_fa>
	<keyword>Sequencing, mitochondrial D-loop, Sturgeon,Tandom repeat, Caspian sea</keyword>
	<start_page>13</start_page>
	<end_page>23</end_page>
	<web_url>http://isfj.ir/browse.php?a_code=A-10-2154-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Kh.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dadkhah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>خدیجه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دادخواه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Kdadkhah29@gmail.com</email>
	<code>100319475328460026621</code>
	<orcid>100319475328460026621</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Sari, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Gh.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>قدرت</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رحیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rahimimianji@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460026622</code>
	<orcid>100319475328460026622</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>-</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farhadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ایوب</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرهادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ayoub_farhadi@ymail.com</email>
	<code>100319475328460026623</code>
	<orcid>100319475328460026623</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>-</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
