Iranian Scientific Fisheries Journal
مجله علمي شيلات ايران
isfj
Agriculture
http://isfj.ir
1
admin
1026-1354
2322-5998
10.18869/acadpub.isfj
000000
000000
000000
fa
jalali
1399
11
1
gregorian
2021
2
1
29
6
online
1
fulltext
fa
مقاله علمی – پژوهشی: بررسی تغییرپذیری ژنتیکی جمعیتهای سیاه ماهی خالدار Capoeta trutta (Heckel, 1843) استان کردستان با استفاده از نشانگرهای IRAP
IRAP
Evaluation of genetic variability of longspine scraper Capoeta trutta (Heckel, 1843) populations from Kurdistan province using IRAP markers
ژنتيك و اصلاح نژاد
ژنتيك و اصلاح نژاد
پژوهشي
Research
<span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">تغییرپذیری ژنتیکی جمعیتهای سیاه ماهی خالدار صید شده از رودخانههای چومان، شوی، گرماب (منطقه بانه)، قشلاق، سیروان، گاوهرود (منطقه سیروان) و روآر (منطقه مریوان) در استان کردستان با استفاده از نشانگرهای چندشکلی تکثیر شده بین رتروترانسپوزونی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">(IRAP)</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;"> مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل دادههای حاصل از نشانگر مولکولی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">IRAP</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;"> نشان</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:Cambria Math,serif;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">داد که بیشترین و کمترین تعداد باندهای مشاهده شده، تعداد و درصد باندهای پلیمورف، تعداد باند متفاوت و اختصاصی، بیشترین تعداد آلل موثر، شاخص شانون و هتروزیگوسیتی مورد انتظار بهترتیب مربوط به جمعیت</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">های روآر و گرماب میباشند. بیشترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت روآر و شوی و کم</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">ترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت چومان و گرمآب بود. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 9% واریانس ژنتیکی مربوط به بین مناطق جغرافیایی، 16% مربوط به بین جمعیتها و 75% مربوط به درون جمعیتها میباشد. بیشترین و کمترین مقدار جریان ژنی (تعداد مهاجرت در هر نسل) بهترتیب بین جمعیت</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">های چومان و گرمآب و روآر و شوی مشاهده شد. بررسی روابط خویشاوندی جمعیتها با روش بیشینه پارسیمونی نشان</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:Cambria Math,serif;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">داد که جمعیتهای منطقه مریوان در یک تک شاخه خواهری با جمعیت</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">های مناطق بانه و سیروان قرار دارند. نتایج این پژوهش نشان</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:Cambria Math,serif;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">داد که اگرچه جمعیت سیاه ماهی خالدار منطقه مریوان تفاوتهایی با سایر جمعیتها داشت، ولی وجود شباهتها مانع از جدایی کامل آن می</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">باشد. با این وجود ماهیان متعلق به هر جمعیت از مناطق جغرافیایی مورد بررسی با توجه به داشتن باندهای اختصاصی، قابل تفکیک میباشند. همچنین نتایج این پژوهش نشان </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;">داد که نشانگر </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;">IRAP</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Compset;"><span style="font-size:12.0pt;"> دارای تکرارپذیری بالا و توان بیشتر در آشکار سازی تنوع ژنتیکی است و میتواند به طور موثر در مطالعات بررسی تنوع ژنتیک ماهیان و از جمله گونه سیاه ماهی خالدار مورد استفاده قرار گیرد. </span></span></span>
Genetic variability of longspine scraper populations from the Choman, Shui, Garmab (Baneh region), Gheshlagh, Sirvan, Gaveh-Rud (Sirvan region), Rowar (Marivan region) of Kurdistan province were examined using Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism markers (IRAP) method. IRAP molecular markers data analysis showed the highest and the lowest number of bands, polymorphic bands, percent of polymorphic bands, number of different bands, number of private bands, number of effective bands, Shannon's information index and expected heterozygosity in the Rowar and the Garmab populations, respectively. The highest and the lowest genetic distance was observed between the Rowar and the Shui populations and between the Choman and the Garmab populations, respectively. The molecular variance analysis results revealed that 9% of genetic variance was between geographic regions, 16% among and 75% within the populations. The highest and lowest gene flow rates (number of migrations per generation) were observed among the Choman, Garmab, Rowar and Shui populations, respectively. Phylogentic relationships of the populations were evaluated using the maximum parsimony methods. Phylogenetic analysis showed that the Marivan region is in a sister clade with the regions of Baneh and Sirvan. The results of this study showed that although the longspine scraper population of Marivan region was different from other populations, the existence of similarities prevents its complete separation. However, fish belonging to each population of the studied geographical areas can be distinguished by their private bands. The results of this research showed that the IRAP marker has high reproducibility and greater power in detecting genetic diversity and can be used effectively to study the genetic diversity of fish, including the longspine scraper species.
سیاه ماهی خالدار (Capoeta trutta), نشانگر IRAP, تغییرپذیری ژنتیکی
Capoeta trutta, Morphological traits, IRAP marker, Genetic variability
65
76
http://isfj.ir/browse.php?a_code=A-10-2585-1&slc_lang=fa&sid=1
Zahra
Mehrabani
زهرا
مهربانی
zahramehrabani70@gmail.com
3770115457
100319475328460031146
No
university of Kurdistan
دانشگاه کردستان
Barzan
Bahrami Kamangar
برزان
بهرامی کمانگر
bbkamangar@uok.ac.ir
3839568730
100319475328460031147
Yes
university of Kurdistan
دانشگاه کردستان
Edris
Ghaderi
ادریس
قادری
ed.ghaderi@gmail.com
3762029431
100319475328460031148
No
university of Kurdistan
دانشگاه کردستان