محمود توکلی الموتی، قدرت رحیمی میانجی، اردشیر نجاتی جوارمی، الهام یونسی، ایوب فرهادی،
دوره ۳۱، شماره ۴ - ( ۸-۱۴۰۱ )
چکیده
در این مطالعه با استفاده از فناوری RNA-seq اثر تنظیمی سیس و ترانس ژنهای غیر کد شونده بلند (lncRNA) در بیان ژنها در ماهیان آلوده به ویروس سپتی سمی هموراژیک خونریزی‌دهنده (VHS) مورد بررسی قرار گرفت. در پایان دوره آزمایشی (روز سی و پنجم)، RNA کل از بافت طحال (گروه تیمار شده با ویروس) و سرم فیزیولوژی (گروه شاهد) و برای آماده‌سازی کتابخانه برای mRNA-seq، مورد استفاده قرار گرفت. نتایج آنالیز RNA-seq، نشان داد که تعداد ۶۳ ژن lncRNA دارای بیان افتراقی بوده است که با ۹۲ ژن کد شونده به صوت سیس در محدوده ۲۰ هزار باز بالا دست و پایین دست ژنهای مورد نظر ارتباط داشتند. از میان جفت ژنهای کد شونده و lncRNA، آنهایی که همبستگی بیانی بیشتر از مثبت ۹۰ درصد و کمتر از منفی ۹۰ درصد داشتند بهترتیب به عنوان جفت ژنهای با بیان هم‌راستا و غیر هم راستا مورد ارزیابی قرار گرفتند. ژنهای کد شونده Interlukin۱۰،BHLHE۴۱، RBP۴۷، gastrotropin، synaptopodin، OX۲ و SMC۲ با ۸ و ۱۳ ژن lncRNA بهترتیب دارای ارتباط سیس و ترانس بودند. ژنهای Interlukin۱۰، gastrotropin، synaptopodin، OX۲، SMC۲ و دو ژن RBP۴۷ و BHLHE۴۱ بهترتیب در گروه تیمار ویروسی و گروه شاهد بیان بالاتری نشان دادند. تجزیه و تحلیل هستی‌شناسی ژنها نشان‌‌دهنده فعالیت ژنهای سایتوکینی از جمله ژن اینترلوکین ۱۰ بود که در پاسخ‌های التهابی در سیستم ایمنی نقش مهمی دارد.
.png)
