|
|
 |
جستجو در مقالات منتشر شده |
 |
|
۱ نتیجه برای Nested Pcr
صفیه شهوازی، آناهیتا رضایی، مسعود رضا صیفی آباد شاپوری، مجتبی علیشاهی، مینا آهنگرزاده، دوره ۳۱، شماره ۳ - ( ۶-۱۴۰۱ )
چکیده
هرپس ویروس نوع ۳ (CyHV-۳)، عامل اصلی بیماری واگیردار کوی هرپس ویروس (KHVD) در ماهی کپور معمولی و کوی در سرتاسر جهان است. بدین منظور از ۶۰ قطعه ماهی کپور معمولی از مزارع تلفات دار و مزارع استان خوزستان که در چند سال اخیر تلفات گزارش کرده بودند، طی سالهای ۱۴۰۰-۱۳۹۶، جهت ردیابی بیماری ویروس هرپس کوی به روش مولکولی نمونه برداری شد. جهت افزایش بار ویروس در بافتهای آبشش و کلیه، به ازای سه ماهی، سه نمونه آبشش و سه نمونه کلیه به صورت جداگانه با یکدیگر مخلوط شدند. استخراج DNA بافت با استفاده از کیت تجاری شرکت رهازیست پادتن طبق دستورالعمل کیت انجام شد. سپس آزمایش واکنش زنجیرهای پلیمراز آشیانهای با استفاده از مسترمیکس Amplicon و پرایمرهای مربوط به ژن پلیمراز انجام شد. نتایج حاصل از Nested PCR نشان داد که ۳ نمونه (دو نمونه آبشش و یک نمونه بافت کلیه) از ۴۰ نمونه مخلوط شده مورد آزمایش دارای باند ۳۳۹ کیلوجفت باز بودند و به عنوان نمونه مثبت در نظر گرفته شدند. تعیین توالی محصولات PCR و آنالیز اولیه Blast نشان داد که توالی یکی از نمونههای مثبت به توالیهای مربوط به CyHV-۳ شباهت داشت. نتایج همترازی ردیفهای نوکلئوتیدی و درخت فیلوژنی این توالی، کوی هرپس ویروس را با قطعیت تشخیص داده و با شماره دسترسی LC۷۱۳۲۷۶ در بانک ژن جهانی ثبت گردید.
|
|