تحقیقات هیدروبیولوژیک رودخانه ارس در نواحی میانی و انتهایی آن در سالهای 1376-1375 و 1386-1385نمایانگر حضور 91 گونه از بی مهرگان کفزی، شامل 85 گونه طی سالهای 1375 و 1376و 49 گونه در سالهای 1385 و 1386 بوده است. این گونه ها متعلق به 14 رده معمول در آب رودخانه ها بودند، که نرمتنان با 19 گونه و کرمهای خونی با 17 گونه بیشترین تنوع گونه ای را داشتند. از این گروههای جانوری 42 گونه دارای پراکنش گسترده در تمام مقاطع رودخانه ولی بقیه گونه ها فقط در بیوتوپهای خاصی پراکنده اند. تراکم وزنی توده زنده بی مهرگان کفزی از مناطق ابتدایی تا انتهای رودخانه بدلیل تغییر جنس بافت بستر رودخانه از خاکی به شنی بتدریج کمتر می شود. تشکیل بیوتوپ های گوناگون در مقاطع مختلف این رودخانه نقش مهمی در افزایش تنوع گونه ای بی مهرگان کفزی در آن را ایفا کرده است.