|
مقاله علمی – پژوهشی: برآورد میزان تنوع ژنتیکی در ذخیره مولدین فیل‌‌ماهی (Huso huso Linnaeus, 1758) با استفاده از داده‌های حاصل از توالی یابی ژنوم
|
امید جعفری1   ، ناصر کرمی راد2 ، مهدی گلشن3 ، علی نقی سرپناه1 ، مهرشاد زین العابدینی4 ، اسماعیل عبداله زاده1 ، محمد حسن زاده صابر1 ، مریم نصراله پورمقدم2 ، مهدی شکوری2 ، محمود محسنی1 |
1- انستیتو تحقیقات بین المللی ماهیان خاویاری، مؤسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران
2- سازمان شیلات ایران
3- مؤسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
4- پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران |
|
|
چکیده: (16 مشاهده) |
فیل‌‌ماهی به عنوان اصلی‌ترین گونه پرورشی از ماهیان خاویاری در ایران مطرح بوده که ذخیره مولدین کنونی آن از تعداد محدودی مولد وحشی در دو گذشته ایجاد شده است. فقدان گونه‌‌های شناسنامه‌دار یکی از مهم‌ترین عوامل محدودکننده در توسعه صنعت آبزی‌پروری ماهیان خاویاری در ایران بوده است. از این‌رو، در پروژه حاضر و برای اولین بار از تکنیک توالی‌‌یابی مبتنی بر ژنوم به منظور برآورد تنوع ژنتیکی و تهیه شناسنامه مولکولی مبتنی بر ژنوم از ذخیره مولدین فیل‌‌ماهی موجود در انستیتو ماهیان خاویاری، استفاده شد. توالی‌‌یابی ژنومی منجر به تولید GB294 داده حاصل از 261974459 خوانش ژنومی شد که در نهایت باعث شناسایی 1836 نشانگر SNP در ژنوم فیل‌‌ماهی شد که بیشترین تعداد آن بر کروموزوم شماره 58 مشاهده شد. نتایج حاصل از تجزیه‌‌وتحلیل SNPs کشف‌‌شده نشان داد که میزان هتروزیگوسیتی موردمشاهده در ذخیره مولدین فیل‌‌ماهی موجود در انستیتو، 35/0 است. همچنین 105 آلل در ذخیره مولدین مورد بررسی یافت شد که بیانگر تنوع آللی مناسب در این گونه بود. نتایج حاصل از روابط هم‌‌تباری با استفاده از مارکرهای SNP شناسایی شده برای اولین بار نشان داد که ذخیره ژنتیکی مولدین فیل‌‌ماهی در انستیتو در دو خوشه ژنتیکی، قابل تقسیم بندی هستند. میزان همخونی در مولدین فیل‌‌ماهی مورد بررسی 02/0 برآورد گردید که این میزان پایین همخونی در کنار ساختار جمعیتی مختلط مورد مشاهده در آزمون PCA می‌تواند بیانگر تنوع بالا در مولدین وحشی ایجادکننده جمعیت حاضر باشد. با توجه به دسترسی بسیار محدود به مولدین وحشی برای غنی‌سازی خزانه ژنی گله‌های پرورشی، پیشنهاد می‌‌گردد تا با استفاده از روش‌‌های نوین مبتنی بر ژنومیکس در زمینه شناسایی خزانه‌های ژنی، حفظ ساختارهای ژنتیکی و تکثیر هدفمند بر اساس اطلاعات ژنتیکی در بازسازی ذخایر و آبزی‌پروری اقدام گردد.
Single nucleotide polymorphism (SNP)
|
|
| واژه‌های کلیدی: چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی، خزانه ژنی، درون‌آمیزی، ژنومیکس، ماهیان خاویاری |
|
|
متن کامل [PDF 648 kb]
(5 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
ژنتيك و اصلاح نژاد
دریافت: 1404/4/16 | پذیرش: 1404/5/10
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
.png)
