[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 31، شماره 4 - ( 8-1401 ) ::
جلد 31 شماره 4 صفحات 14-1 برگشت به فهرست نسخه ها
مقاله علمی – پژوهشی:‌ اثرات تنطیمی سیس و ترانس LncRNA در بیان افتراقی ژن‌ها طی آلودگی ویروس سپتی سمی خونریزی‌دهنده (Viral Hemorrhagic Septicemia) در ماهی قزل‌آلای رنگین‌‌کمان (Oncorhyncus mykiss)
محمود توکلی الموتی ، قدرت رحیمی میانجی، اردشیر نجاتی جوارمی، الهام یونسی، ایوب فرهادی*
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده:   (180 مشاهده)
در این مطالعه با استفاده از فناوری RNA-seq اثر تنظیمی سیس و ترانس ژن‌‌های غیر کد شونده بلند (lncRNA) در بیان ژن‌‌ها در ماهیان آلوده به ویروس سپتی سمی هموراژیک خونریزی‌دهنده (VHS) مورد بررسی قرار گرفت. در پایان دوره آزمایشی (روز سی و پنجم)، RNA کل از بافت طحال (گروه تیمار شده با ویروس) و سرم فیزیولوژی (گروه شاهد) و  برای آماده‌سازی کتابخانه برای mRNA-seq، مورد استفاده قرار گرفت. نتایج آنالیز RNA-seq، نشان داد که تعداد 63 ژن lncRNA دارای بیان افتراقی بوده است که با 92 ژن کد شونده به صوت سیس در محدوده 20 هزار باز بالا دست و پایین دست ژن‌‌های مورد نظر ارتباط داشتند. از میان جفت ژن‌‌های کد شونده و lncRNA، آنهایی که همبستگی بیانی بیشتر از مثبت 90 درصد و کمتر از منفی 90 درصد داشتند به‌ترتیب به عنوان جفت ژن‌‌‌‌های با بیان هم‌راستا و غیر هم راستا مورد ارزیابی قرار گرفتند. ژن‌‌های کد شونده Interlukin10،BHLHE41، RBP47، gastrotropin، synaptopodin، OX2 و SMC2 با 8 و 13 ژن lncRNA به‌‌ترتیب دارای ارتباط سیس و ترانس بودند. ژن‌های Interlukin10، gastrotropin، synaptopodin، OX2، SMC2 و دو ژن RBP47 و BHLHE41 به‌‌ترتیب در گروه تیمار ویروسی و گروه شاهد بیان بالاتری نشان دادند. تجزیه و تحلیل هستی‌شناسی ژن‌‌ها نشان‌‌دهنده فعالیت ژن‌‌های سایتوکینی از جمله ژن اینترلوکین 10 بود که در پاسخ‌های التهابی در سیستم ایمنی نقش مهمی دارد.
واژه‌های کلیدی: ماهی قزل آلای رنگین‌‌کمان، ویروسVHS، RNAseq، lncRNA، سیس و ترانس
متن کامل [PDF 813 kb]   (87 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتيك و اصلاح نژاد
دریافت: 1401/3/18 | پذیرش: 1401/8/10 | انتشار: 1401/8/10
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tavakoli alamouti M, Rahimi mianji G, Nejati javaremi A, Younesi E, Farhadi A. Regulatory effects of cis- and trans-LncRNAs on differential expression of genes following infection with viral hemorrhagic septicemia virus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). isfj 2022; 31 (4) :1-14
URL: http://isfj.ir/article-1-2617-fa.html

توکلی الموتی محمود، رحیمی میانجی قدرت، نجاتی جوارمی اردشیر، یونسی الهام، فرهادی ایوب. مقاله علمی – پژوهشی:‌ اثرات تنطیمی سیس و ترانس LncRNA در بیان افتراقی ژن‌ها طی آلودگی ویروس سپتی سمی خونریزی‌دهنده (Viral Hemorrhagic Septicemia) در ماهی قزل‌آلای رنگین‌‌کمان (Oncorhyncus mykiss). مجله علمي شيلات ايران 1401; 31 (4) :14-1

URL: http://isfj.ir/article-1-2617-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 31، شماره 4 - ( 8-1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها

با کسب مجوز از دفتر کمیسیون بررسی نشریات علمی وزارت علوم، تحقیات و فنآوری مجله علمی شیلات بصورت آنلاین می باشد و تعداد محدودی هم به چاپ می رساند. شماره شاپای جدید آن ISSN:2322-5998 است

Persian site map - English site map - Created in 0.04 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4505