1- دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری 2- هلدینگ مبارک اندیش 3- موسسه ژنتیک و بیوتکنولوژی کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
چکیده: (1680 مشاهده)
در این مطالعه با استفاده از فناوری RNA-seq اثر تنظیمی سیس و ترانس ژنهای غیر کد شونده بلند (lncRNA) در بیان ژنها در ماهیان آلوده به ویروس سپتی سمی هموراژیک خونریزیدهنده (VHS) مورد بررسی قرار گرفت. در پایان دوره آزمایشی (روز سی و پنجم)، RNA کل از بافت طحال (گروه تیمار شده با ویروس) و سرم فیزیولوژی (گروه شاهد) و برای آمادهسازی کتابخانه برای mRNA-seq، مورد استفاده قرار گرفت. نتایج آنالیز RNA-seq، نشان داد که تعداد 63 ژن lncRNA دارای بیان افتراقی بوده است که با 92 ژن کد شونده به صوت سیس در محدوده 20 هزار باز بالا دست و پایین دست ژنهای مورد نظر ارتباط داشتند. از میان جفت ژنهای کد شونده و lncRNA، آنهایی که همبستگی بیانی بیشتر از مثبت 90 درصد و کمتر از منفی 90 درصد داشتند بهترتیب به عنوان جفت ژنهای با بیان همراستا و غیر هم راستا مورد ارزیابی قرار گرفتند. ژنهای کد شونده Interlukin10،BHLHE41، RBP47، gastrotropin، synaptopodin، OX2 و SMC2 با 8 و 13 ژن lncRNA بهترتیب دارای ارتباط سیس و ترانس بودند. ژنهای Interlukin10، gastrotropin، synaptopodin، OX2، SMC2 و دو ژن RBP47 و BHLHE41 بهترتیب در گروه تیمار ویروسی و گروه شاهد بیان بالاتری نشان دادند. تجزیه و تحلیل هستیشناسی ژنها نشاندهنده فعالیت ژنهای سایتوکینی از جمله ژن اینترلوکین 10 بود که در پاسخهای التهابی در سیستم ایمنی نقش مهمی دارد.
Tavakoli alamouti M, Rahimi mianji G, Nejati javaremi A, Younesi E, Farhadi A. Regulatory effects of cis- and trans-LncRNAs on differential expression of genes following infection with viral hemorrhagic septicemia virus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). isfj 2022; 31 (4) :1-14 URL: http://isfj.ir/article-1-2617-fa.html
توکلی الموتی محمود، رحیمی میانجی قدرت، نجاتی جوارمی اردشیر، یونسی الهام، فرهادی ایوب. مقاله علمی – پژوهشی: اثرات تنطیمی سیس و ترانس LncRNA در بیان افتراقی ژنها طی آلودگی ویروس سپتی سمی خونریزیدهنده (Viral Hemorrhagic Septicemia) در ماهی قزلآلای رنگینکمان (Oncorhyncus mykiss). مجله علمي شيلات ايران. 1401; 31 (4) :1-14
با کسب مجوز از دفتر کمیسیون بررسی نشریات علمی وزارت علوم، تحقیات و فنآوری مجله علمی شیلات بصورت آنلاین می باشد و تعداد محدودی هم به چاپ می رساند. شماره شاپای جدید آن ISSN:2322-5998 است